这是一个时代的标志:一个面向组学爱好者的应用商店。到2024年底，多组学分析门户(MAP)将成为能够理解各种大量组学数据的计算机应用程序的一站式商店。基因组学，蛋白质组学，脂质组学，转录组学——都是受欢迎的。
来自太平洋西北国家实验室(PNNL)和环境分子科学实验室的数据科学家丽莎·布拉默和生物统计学家凯利·斯特拉顿几年前开始开发这个商店。到目前为止，该团队已经发布了两个应用程序的测试版，他们预计到今年年底还会增加四个。
Bramer说:“我们正在尝试创造一些可接近但可扩展的东西。“我们的目标是，不要每次我们需要加入新工具、新仪器或新技术时，都在一个超大的应用程序中添加功能。相反，我们可以创建这些更小、更小的应用程序，并将它们放在一个地方，这样研究人员就可以更容易地尽早、经常地获得数据。”
PNNL的生物医学研究员Sneha couvilion是MAP商店的早期采用者和粉丝。
“我喜欢它。对于像我这样的非统计学家来说，这是一个很好的工具，可以对你的数据进行基本的统计分析。”她说，这对规模较小的研究尤其有帮助，她希望在决定如何进行之前快速查看数据。
她补充说，在学术界，“……拥有一个生物统计学家团队并不典型。这是我们PNNL的奢侈品。”但她说，即使有一个团队，数据分析的队列也可以得到备份。有了MAP及其应用程序，研究人员现在可以随心所欲地钻研数据。如果他们需要额外的分析，他们可以请一位生物统计学家来帮忙。
“这是一个过程的改进，除了是一套工具，”Bramer说。“通常情况下，实验将从设计到台式，再到仪器，再到数据分析，直到生物统计学家和他们一起检查数据，研究人员才会看到数据。”
使用MAP中的一个应用程序PMart, Couvillion只需要半个小时就可以用一个简单的数据集将原始数据转换为最终统计数据。这使她能够仔细考虑这些信息并决定下一步——通常会发展到一个更大的实验，由于初始数据而设计得更严密。
多年来，可视化一直是数据分析的重要补充。有些人喜欢列表或文本行，而另一些人喜欢图片。在可视化之前，后者陷入了困境，(可能)很难理解他们的数据。
在PNNL实验室指导研究和开发计划的支持下，PMart工具扩展到处理一般组学和其他数据类型。该工具现在执行质量控制并为统计比较准备数据。它还包括方便的摘要可视化-所有这些都可以单独下载并保存为报告，甚至包括统计学家可以重现的计算命令。这对科学界中使用MAP应用程序但想要或需要与专业统计学家进一步分析的人尤其有帮助。
此外，应用程序可以在它们之间传输数据以进行额外的分析。例如，PMart可以生成数据类型，并将其放入另一个名为MODE的应用程序。
MODE在发现趋势和创建交互式视觉显示方面表现出色。与主成分分析等传统的总结图表不同，主成分分析可能忽略了显示重要信息和发现，MODE提供了测量和分析的每个生物分子的详细可视化，并帮助用户优先考虑调查结果。
太平洋西北国家公司提供 部分实验室 引用新的应用程序帮助研究人员对2024年4月22日从https://techxplore.com/news/2024-04-apps-statistical-analyses.html检索的数据(2024年4月16日)进行统计分析 作品受版权保护。除为私人学习或研究目的而进行的任何公平交易外，未经书面许可，不得转载任何部分。的有限公司 内容仅供参考之用。
